MUY IMPORTANTE: la instalación del software debe hacerse nueva en cada R4: Si se copian los archivos de una tarjeta R4 de otra Nintendo DS no funcionará.
1) La instalación de software
Conecta la tarjeta micro SD al ordenador mediante el conector USB. Formatea la tarjeta antes de instalar el software. Necesitará WinRar u otro programa parecido para descomprimir los archivos.
Sólo se deben copiar los archivos contenidos en la carpeta "Version_3.02" en la tarjeta de memoria (no la carpeta). Los archivos que deben ser copiados son los siguientes:
_DS_MENU.DAT
_R4__III.DAT
_DS_MSHL.NDS
y las carpetas
_system_
moonshl
Si lo deseas (!muy recomendado!) crea una carpeta "juegos" en el mismo nivel que los archivos anteriores. Copia tus juegos siempre dentro de esta carpeta y así lograrás que tus juegos no se mezclen con el sistema operativo.
2) Desconecta la tarjeta de memoria del ordenador e insertar en tu Nintendo DS fuera. Utiliza el icono de "desconectar hardware" en la parte inferior derecha de su PC si su sistema es Windows. Si eliminas directamente la tarjeta de memoria sin utilizar el procedimiento de seguridad, los ficheros pueden resultar dañados y / o eliminados.
3) Menú
Inserta la tarjeta de memoria en el cartucho R4III y éste a su vez en la ranura-1. Enciende la consola. La interfaz gráfica será visible en unos pocos segundos. Haz clic en el icono de la carpeta "juegos".

Aparecerá el directorio en la pantalla a continuación:

Pulsa el botón derecho en la consola.
Aparecerá la lista de juegos en la pantalla anterior. Selecciona con las teclas de flecha el juego que desee y pulsa la A para cargarlo.
Precaución: no te olvides de quitar el cartucho R4 DS cuando la consola esté apagada.